دراسات وراثية جزيئية على بعض أصناف قصب السكر المحلية والأجنبية"

  "في صوب ومعامل قسم الوراثة كلية الزراعة جامعة عين شمس- شبرا الخيمة- القليوبية- مصر في الفترة من 2003 الى 2008  وكانت أهداف هذه الدراسة:

أولا : تقييم بعض الأصناف المبشرة من قصب السكر لمقاومة الإجهاد الحيوى (مرض التفحم) GT 54/9, PH8013, G99/165, G95/19, G95/21, G98/28, G98/24, G84/47, G85/37  و NCo310.  وجارى إنتخاب هذه الأصناف منذ عدة أجيال بمعهد بحوث المحاصيل السكرية بالجيزة لتحسين صفاتها الإنتاجية وذلك مقارنة بالصنفين التجاريين G54/9 & PH8013 وفى وجود صنف حساس لمرض التفحم NCo310 

ثانيا عمل البصمة الوراثية الجزيئيه للاصناف محل الدراسة وإيجاد درجة القرابة الوراثية بينها.

 ثالثا الحصول على كشافات جزيئية لمرض التفحم للأصناف تحت الدراسة و ذلك من خلال تقنيات التفريد الكهربي للأحماض النووية باستخدام تقنيات RAPD, ISSR  SSR.       

ويمكن تلخيص أهم النتائج فى النقاط الأساسية الأتية:-

1.   أجريت تجربة العدوى الصناعية تحت ظروف الصوبة الزجاجية وذلك فى وجود صنف حساس لمرض التفحم NCo310 وتتلخص نتيجة تجربة العدوى الصناعية فى وجود مقاومة الأصناف التسعة لمرض التفحم حيث أظهرت جميع الأصناف مقاومة للمرض بدرجات مختلفة مقارنة بالصنف الحساس.      

2.   تم عمل التحاليل البيوكيماوية على مستوى الأحماض النووية وذلك باستخلاصها وعمل التفريد الكهربي لها باستخدام تقنيات RAPDs, ISSRs & SSRs.  حيث تم الحصول على كشافات وراثية جزيئية مرتبطة بمقاومة مرض التفحم

3.   باستخدام تقنية الـRAPD-PCR  تم الحصول على العديد من الحزم المميزة التى تستخدم ككشافات موجبة لمقاومة مرض التفحم: أعطى البادئ OP-C05 ثلاثة حزم عند الحجم الجزيئى 1470 1360 و 400 زوج من القواعد. أما البادئ OP-C20 فقد أظهر حزمة عند الحجم الجزيئى 430 زوج من القواعد. كذلك أظهر البادئ OP-M01 حزمتين عند الحجم الجزيئى2400 و 800 زوج من القواعد. بالنسبة للبادئ OP-M17 فقد أعطى حزمة عند الحجم الجزيئى 400 زوج من القواعد. فى حين أظهر البادئ OP-M20 ثلاثة حزم عند الحجم الجزيئى 430 و 300 و 170 زوج من القواعد. 

4.   أيضاُ تم الحصول على العديد من الحزم المميزة التى تستخدم ككشافات جزيئية سالبة لمقاومة مرض التفحم: فقد أعطى البادئ OP-C05 حزمة عند الحجم الجزيئى 420 زوج من القواعد. أما البادئ OP-L20 فقد أظهر حزمة عند الحجم الجزيئى 700 زوج من القواعد. فى حين أظهر البادئ OP-Z03 حزمة عند الحجم الجزيئى 2055 زوج من القواعد.

5.   كذلك تم الحصول على العديد من الحزم المميزة التى ظهرت فى معظم الأصناف المقاومة وغابت فى الصنف الحساس والتى تستخدم ككشافات موجبة لمقاومة مرض التفحم: فقد أظهر البادئ OP-B12 حزمة عند الحجم الجزيئى 370 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس. أما البادئ OP-C05 فقد أظهر حزمة عند الحجم الجزيئى 1230 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس. بينما أظهر البادئ OP-M01 حزمتين عند الحجم الجزيئى 1060 و 270 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية وسبعة  أصناف مقاومة (على التوالى) وغابت فى الصنف الحساس. كذلك أظهر البادئ OP-M20 خمسة حزم فى معظم الأصناف المقاومة كانت كالتالى: حزمتين عند الحجم الجزيئى 1500 و1240 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس، وحزمتين عند الحجم الجزيئى 1000 و 580 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ستة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس، وحزمة عند الحجم الجزيئى 480 زوج من القواعد والتى ظهرت فى سبعة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس. بينما أعطى البادئ OP-Z03 خمسة حزم عند الحجم الجزيئى 2210 و1840 و1550 و 690 و 350 زوج من القواعد والتى ظهرت فى سبعة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس، كما أظهر حزمتين عند الحجم الجزيئى 560 و 160 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ستة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس. كذلك أظهر البادئ OP-O18 حزمة عند الحجم الجزيئى 410 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ستة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس. فى حين أعطى البادئ OP-O20 حزمة عند الحجم الجزيئى 390 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس.

6.   باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل للتتابعات المتكررة ((ISSR-PCR  تم الحصول على حزمة مميزة تستخدم ككشاف موجب لمقاومة مرض التفحم باستخدام البادئ  HB9 عند الحجم الجزيئى 600 زوج من القواعد. أيضاًُ تم الحصول على العديد من الحزم المميزة التى تستخدم كشافات جزيئية سالبة لمقاومة مرض التفحم: فقد أظهر البادئ HB13 حزمة عند الحجم الجزيئى 1300زوج من القواعد. أما البادئ B98 فقد أعطى حزمة عند الحجم الجزيئى 180 زوج من القواعد.

7.   كذلك تم الحصول على العديد من الحزم المميزة التى ظهرت فى معظم الأصناف المقاومة وغابت فى الصنف الحساس والتى تستخدم ككشافات موجبة لمقاومة مرض التفحم: حيث أعطى البادئ HB9 ثلاثة حزم عند الحجم الجزيئى 510و 430 و 380 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية وسبعة و وستة  أصناف مقاومة (على التوالى) وغابت فى الصنف الحساس. فى حين أظهر البادئ HB10 حزمتين عند الحجم الجزيئى 480 و400 زوج من القواعد والتى ظهرت فى سبعة و ستة أصناف مقاومة (على التوالى) وغابت فى الصنف الحساس. أما البادئ HB11 فقد أعطى حزمتين عند الحجم الجزيئى 700و 180 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ثمانية أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس، وحزمة عند الوزن الجزيئى 630 زوج من القواعد والتى ظهرت فى ستة أصناف مقاومة وغابت فى الصنف الحساس.

8.   باستخدام تقنية الـSSR-PCR  تم الحصول على حزمة مميزة تستخدم كشاف  لمقاومة مرض التفحم: حيث أعطى البادئ SMC319CG حزمة عند الوزن الجزيئى 280 زوج من القواعد ظهرت فى الصنف الحساس فقط ولم تظهر فى باقى الأصناف المقاومة لمرض التفحم فى قصب السكر."